E' una delle più antiche Farmacie di Firenze e forse d'Italia dal momento che alcuni documenti ne attestano l'esistenza già alla fine del XIII secolo. A quel tempo era una spezieria ed aveva come insegna un diamante, tanto che l'angolo di strada su cui si trova si chiamava "Canto al Diamante".

Si dice che Dante, iscritto all'arte dei Medici e degli Speziali, la frequentasse abitualmente.

Nei secoli fu sempre proprietà di nobili famiglie fiorentine, finchè nel 1892 prese l'attuale nome di Farmacia Molteni ed ebbe come direttore Alfredo Alitti, giovane farmacista marchigiano. Egli creò nel retrofarmacia un vero e proprio laboratorio con il quale riuscì nel 1894 a produrre, per primo in Italia, fiale sterili per uso ipodermico che ebbero una grande e rapida diffusione, tanto che furono usate anche per curare Giuseppe Verdi negli ultimi anni di vita.

La produzione ebbe uno sviluppo imponente, tale da dover ampliare i laboratori trasferendoli in un magazzino in Viale Principe Amedeo attiguo a Piazza Cavour, oggi Piazza Della Libertà.

Tra le varie preparazioni farmaceutiche ricordiamo lo STERIDROLO MOLTENI che, come riportato sui testi di storia, fu utilizzato dall'esercito italiano nella campagna d'Africa per disinfettare l'acqua da bere, compresa quella delle pozzanghere.

Vista la crescita della produzione sorse nel 1914 lo stabilimento "Chimico-Farmaceutico Molteni" sulle pendici della collina fiesolana.

La farmacia, che occupa alcuni ambienti del Palazzo di Calimala, ha mantenuto l'aspetto trecentesco solo nelle strutture portanti dal momento che l'attuale sistemazione degli interni risale al secolo XIX.

Le volte a crociera sono decorate con stucchi in oro su fondo crema di gusto tardo neo-classico.

Gli arredi costituiti da armadi alle pareti e da un bancone ad "L" con intarsi e decorazioni in oro raffiguranti gli emblemi dell'arte medica, sono opera dello scultore fiorentino G. Duprè (1817-1882).